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PuTTy é um programa cliente para protoclos de rede SSH, Telnet e Rlogin.

Esses protocolos são usados para rodar uma sessão remota num computador, sobre uma rede.
O software implementa o cliente no fim da sessão: o fim no qual a sessão é exibida, ao invés do fim em que ela é executada.
Em termos mais simples: você executa PuTTy numa máquina Windows e diz a ele como conectar-se, por exemplo, a uma máquina Unix.

PuTTy abre uma janela.
Então, qualquer coisa que você digitar na janela será enviada para a máquina Unix e tudo o que a máquina Unix enviar de volta é exibido nessa janela.
Agora você pode trabalhar com uma máquina Unix como se estivesse no seu console.

Você pode fazer muito com esse programa.
É possível logar como root, matar programas com o kill, alterar configurações de arquivos do sistema.
Pode ser utilizado integrado ao WinSCP para proporcionar além de acesso ao servidor via comandos (SSH) a transferência de dados via SFTP.

Cute FTP Home faz transferências de arquivos entre seu PC e computadores remotos.

Você pode usá-lo para publicar sua página na Internet, baixar as úlimas novidades em imagens digitais, músicas e softwares, ou, executar transferências de arquivos entre sua casa e escritório.
Cute FTP Home é fácil, mesmo para novos usuários.
É excelente como a interface é exibida de forma totalmente interativa, com modelos passo a passo de como executar conexões, funcionalidades de continuar transferências interrompidas, editor HTML, fila de transferências, comparação de diretórios, comandos
e muito mais!

FileZilla é um cliente FTP, FTPS e SFTP simplificado e multiplataforma com diferentes recursos, além de uma interface gráfica simples, com todas as funções do programas distribuídas em abas.

Além de estar disponível em 40 idiomas (incluindo o português), o cliente é bem didático, com ícones que facilitam seu manuseio.
Entre seus recursos, um destaque é a capacidade que o FileZilla tem de resumir a transferência de arquivos grandes - até mesmo maiores que 4 GB.
Também se deve destacar a possibilidade de configuração dos limites de velocidades das transferências, para que o cliente não consuma toda a sua conexão com a internet.
O FileZilla também disponibiliza o sistema drag and drop (arraste e solte), o que facilita a interação com o ambiente.
Outro destaque são os marcadores, que facilita a sua vida caso você precise acessar arquivos em diferentes pastas.

Para você que quer usar clientes FTP, mas tem medo de encontrar um monstro de sete cabeças, Filezilla é uma ótima opção.
Sem dúvidas, quando o assunto é o envio de arquivos por FTP, esta é uma das melhores opções disponíveis, seja qual for o seu sistema operacional.
A cada versão, o FileZilla passa por correções e recebe algumas melhorias.
Um exemplo de aprimoramento recente é a possibilidade de usar senhas customizadas mesmo ao usar "anonymous" como nome de usuário.
Isso sem mencionar a interface traduzida para o português, agradável e fácil de trabalhar.
Ganhador do 2006 SourceForge.net Community Choice Awards e escolhido como Projeto do mês de novembro de 2003, Filezilla está entre os clientes mais famosos do mundo, e é licenciado pela GNU General Public License como software de código aberto.
Portanto é um software de qualidade, seguro e completo.

WinSCP é um cliente SFTP e FTP, que permite acessar, transferir e manipular arquivos remotamente, ou seja, você tem acesso à todos os arquivos permitidos sem que precise estar em frente ao computador.

É possível também fazer transferência de arquivos entre o computador e aparelhos como iPhone, PDAs e qualquer aparelho que tenha suporte à conexões FTP ou SFTP.

Para que a transferência dos arquivos seja segura, WinSCP utiliza Secure Shell (SSH), um protocolo que utiliza um poderoso método de criptografia (
Public Key Cryptography)
de maneira que nenhum arquivo enviado ou senha digitada sejam facilmente interceptados.
O tipo de criptografia utilizado pelo programa é poderoso e difícil de ser quebrado.

basicamente com o reconhecimento de chaves, uma para codificar o dado enviado e outra para decodificar.
Nós não percebemos o processo acontecendo, pois tudo ocorre de forma "automática" e extremamente rápida.
Para facilitar o entendimento, imagine que junto com o dado que você quer enviar está indo uma chave, e no computador para o qual você está tentando enviar os dados há uma fechadura.
A transferência do arquivo acontecerá apenas se a chave que estiver sendo enviada abrir a fechadura do outro computador.

Além da manipulação dos dados entre cliente e servidor, possibilita a alteração dos dados direto no servidor...